Karijera u nacionalnom dresu trajala mu je od 2002. i debija pod vodstvom Karela Brücknera koji mu je dao priliku kao 19-godišnjaku. Oproštaj dolazi nakon eliminacije Češke s Europskog prvenstva na kojem je osvojila jedan bod u utakmicama po skupinama. Čech ga je u 'džep' spremio u ogledu protiv Hrvatske koji je završio rezultatom 2:2 i ostao upamćen po neredima hrvatskih huligana na tribinama.
'Odluka je konačna i na nju nije utjecao rezultat s Europskog prvenstva premda bih, jasno, više volio da sam se oprostio kao prvak. Sve što radim volim raditi sa svojih sto posto i dolazi vrijeme u kojem ću si neke stvari morati olakšati. Ono još možda nije stiglo, ali kvalifikacije za Svjetsko prvenstvo trajat će dvije godine i mislim da ne bi bilo korektno da svoju odluku obznanim na njihovoj polovici. Zato je odluka pravovremena", objasnio je Čech dodavši da zatvara lijepo poglavlje svoje karijere.
Rekorder po broju nastupa za Češku s reprezentacijom je najviše postigao tijekom Eura 2004. kada je poražen u produžetku polufinala od kasnijeg pobjednika Grčke. Branio je češku mrežu na četirima europskim prvenstvima i nastupao na Svjetskom prvenstvu 2006. godine.
